英语很差怎么过四级:微生物基因序列对比差异大于多少可判定为不同种属？

真核细菌比对18sr dna区域，原核细菌比对16sr dna，这两段是基因的保守序列。

一般在得到基因的上面两个保守序列后（原核、真核各对应一种），将基因序列拿到ncbi上进行blast，根据比对结果在genebank中查询高相似的相关基因序列（一般在96％以上，也有更高的，我以前查到的一个菌均在99.5％以上），然后将序列输入vector nti中进行alignment，得到“进化树”（当然也能使用用MEGA作进化树），相关种属关系在进化树中一目了然了。

ncbi（分子生物学研究者的圣地之一）：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

ncbi blast：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/

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我是四楼，2006-6-18补充说明。

这样吧，你把序列发给我吧，我帮你比对后把进化树发给你。

我的邮箱在我个人资料中有。

当然如果你自己就熟悉vector nti之类的软件，那我想我也无能为力了，但是依靠该软件通过进化树确定菌株种属的可行性是毫无疑问的，我们这本身也是通过此方法鉴定菌株的，当然前提是菌株测序的准确性。

不能这么看

DNA G­­­­­­­­­+Cmol％ GC含量差异即可确定DNA的不同,这是真菌分类鉴定的重要遗传指标之一.一般认为，G+C mol%差别大于20%是不同属的菌；差别在10%～15%之间是同属不同种，差别在5%以内则可能是种内不同菌株.但是G­­­­­­­­­+Cmol％相同也不能判断属于同一个种，因此，G­­­­­­­­­+Cmol％只具有否定价值

所以最重要的方法是核酸杂交技术,其中应用最多的是DNA-DNA杂交,即:

2.采用示踪物标记的一条DNA分子与另一条在适当条件下杂交，可获得两者间的杂交百分率即DNA同源性，以此判断两菌株是否属同一种。一般在相同的菌种中，DNA/DNA杂交的成功率高达80%以上，若低于20%基本可考虑为无关菌系，65%～80%之间的菌有较多的同源性，提示为同一属的不同种。但如结果在20%～25%范围时则难以作出判断，应并用其它方法分析确定

3.对属或属以上水平的分类则采用DNA/rRNA杂交，因为rRNA在进化过程中保守性更强。例如,Kurtzman等在对黄曲霉群中各菌种的DNA关系研究中，黄曲霉和寄生曲霉显示79%的DNA杂交率，而集峰曲霉和黄曲霉的DNA杂交率只有39%。Kurtzman根据这些研究结果建议把黄曲霉和寄生曲霉划为黄曲霉的两个变种，而集峰曲霉则划分为一个新种。
但由于该技术操作复杂、费时，并且在细菌分类上其应用价值没有测定rRNA序列有意义，所以该技术没有被广泛应用。

1.DNA G­­­­­­­­­+Cmol％ GC含量差异即可确定DNA的不同,这是真菌分类鉴定的重要遗传指标之一.一般认为，G+C mol%差别大于20%是不同属的菌；差别在10%～15%之间是同属不同种，差别在5%以内则可能是种内不同菌株.但是G­­­­­­­­­+Cmol％相同也不能判断属于同一个种，因此，G­­­­­­­­­+Cmol％只具有否定价值

所以最重要的方法是核酸杂交技术,其中应用最多的是DNA-DNA杂交,即:

2.采用示踪物标记的一条DNA分子与另一条在适当条件下杂交，可获得两者间的杂交百分率即DNA同源性，以此判断两菌株是否属同一种。一般在相同的菌种中，DNA/DNA杂交的成功率高达80%以上，若低于20%基本可考虑为无关菌系，65%～80%之间的菌有较多的同源性，提示为同一属的不同种。但如结果在20%～25%范围时则难以作出判断，应并用其它方法分析确定

3.对属或属以上水平的分类则采用DNA/rRNA杂交，因为rRNA在进化过程中保守性更强。例如,Kurtzman等在对黄曲霉群中各菌种的DNA关系研究中，黄曲霉和寄生曲霉显示79%的DNA杂交率，而集峰曲霉和黄曲霉的DNA杂交率只有39%。Kurtzman根据这些研究结果建议把黄曲霉和寄生曲霉划为黄曲霉的两个变种，而集峰曲霉则划分为一个新种。
但由于该技术操作复杂、费时，并且在细菌分类上其应用价值没有测定rRNA序列有意义，所以该技术没有被广泛应用。

1.DNA G­­­­­­­­­+Cmol％ GC含量差异即可确定DNA的不同,这是真菌分类鉴定的重要遗传指标之一.一般认为，G+C mol%差别大于20%是不同属的菌；差别在10%～15%之间是同属不同种，差别在5%以内则可能是种内不同菌株.但是G­­­­­­­­­+Cmol％相同也不能判断属于同一个种，因此，G­­­­­­­­­+Cmol％只具有否定价值

所以最重要的方法是核酸杂交技术,其中应用最多的是DNA-DNA杂交,即:

2.采用示踪物标记的一条DNA分子与另一条在适当条件下杂交，可获得两者间的杂交百分率即DNA同源性，以此判断两菌株是否属同一种。一般在相同的菌种中，DNA/DNA杂交的成功率高达80%以上，若低于20%基本可考虑为无关菌系，65%～80%之间的菌有较多的同源性，提示为同一属的不同种。但如结果在20%～25%范围时则难以作出判断，应并用其它方法分析确定

3.对属或属以上水平的分类则采用DNA/rRNA杂交，因为rRNA在进化过程中保守性更强。例如,Kurtzman等在对黄曲霉群中各菌种的DNA关系研究中，黄曲霉和寄生曲霉显示79%的DNA杂交率，而集峰曲霉和黄曲霉的DNA杂交率只有39%。Kurtzman根据这些研究结果建议把黄曲霉和寄生曲霉划为黄曲霉的两个变种，而集峰曲霉则划分为一个新种。
但由于该技术操作复杂、费时，并且在细菌分类上其应用价值没有测定rRNA序列有意义，所以该技术没有被广泛应用。

参考资料：http://study.hactcm.edu.cn/ShowContent.asp?ContentID=1147
回答者：lilodido - 见习魔法师 二级 6-17 04:38

生物信息学
http://www1.glmc.edu.cn/genome/index9.asp
专业的介绍,你自己看吧!结果自己定夺的好!!!!